Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRN3Q9NYV6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRN3Q9NYV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RRN3Q9NYV6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms