Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PIF1Q9H611 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIF1Q9H611 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIF1Q9H611 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms