Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POP1Q99575 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP1Q99575 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP1Q99575 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP1Q99575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POP1Q99575 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POP1Q99575 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POP1Q99575 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POP1Q99575 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POP1Q99575 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POP1Q99575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POP1Q99575 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POP1Q99575 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP1Q99575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP1Q99575 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POP1Q99575 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POP1Q99575 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP1Q99575 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP1Q99575 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP1Q99575 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POP1Q99575 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POP1Q99575 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP1Q99575 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP1Q99575 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP1Q99575 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POP1Q99575 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms