Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGAP3Q96P47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms