Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF488Q96MN9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF488Q96MN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms