Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NSMCE2Q96MF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NSMCE2Q96MF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms