Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABS1Q96KC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CABS1Q96KC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms