Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL1Q8WXF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATL1Q8WXF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms