Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SKA2Q8WVK7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKA2Q8WVK7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms