Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL8

TMEM116, Transmembrane protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116Q8NCL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM116Q8NCL8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM116Q8NCL8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms