Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KIRREL3Q8IZU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIRREL3Q8IZU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms