Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMPRSS12Q86WS5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMPRSS12Q86WS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMPRSS12Q86WS5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms