Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPATA24Q86W54 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA24Q86W54 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA24Q86W54 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms