Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLCO6A1Q86UG4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLCO6A1Q86UG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO6A1Q86UG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO6A1Q86UG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO6A1Q86UG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms