Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CC2D1AQ6P1N0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1AQ6P1N0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CC2D1AQ6P1N0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms