Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
INTS3Q68E01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
INTS3Q68E01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
INTS3Q68E01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms