Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG9BQ674R7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG9BQ674R7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG9BQ674R7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms