Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNYL2Q5T2Q4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL2Q5T2Q4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms