Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PHLDA2Q53GA4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHLDA2Q53GA4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHLDA2Q53GA4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms