Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ZNF260Q3ZCT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZNF260Q3ZCT1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
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