Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDO1Q16878 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDO1Q16878 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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