Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB11BQ15907 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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RAB11BQ15907 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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RAB11BQ15907 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB11BQ15907 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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