Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB11BQ15907 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB11BQ15907 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RAB11BQ15907 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RAB11BQ15907 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB11BQ15907 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RAB11BQ15907 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11BQ15907 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11BQ15907 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB11BQ15907 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB11BQ15907 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB11BQ15907 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11BQ15907 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11BQ15907 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11BQ15907 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB11BQ15907 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB11BQ15907 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB11BQ15907 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB11BQ15907 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB11BQ15907 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAB11BQ15907 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAB11BQ15907 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11BQ15907 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11BQ15907 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11BQ15907 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11BQ15907 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11BQ15907 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB11BQ15907 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB11BQ15907 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB11BQ15907 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11BQ15907 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAB11BQ15907 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB11BQ15907 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAB11BQ15907 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAB11BQ15907 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB11BQ15907 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11BQ15907 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB11BQ15907 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11BQ15907 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB11BQ15907 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB11BQ15907 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11BQ15907 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11BQ15907 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11BQ15907 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11BQ15907 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11BQ15907 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11BQ15907 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11BQ15907 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB11BQ15907 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB11BQ15907 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB11BQ15907 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB11BQ15907 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11BQ15907 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB11BQ15907 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11BQ15907 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB11BQ15907 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB11BQ15907 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB11BQ15907 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB11BQ15907 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB11BQ15907 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB11BQ15907 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB11BQ15907 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11BQ15907 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11BQ15907 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11BQ15907 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11BQ15907 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11BQ15907 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB11BQ15907 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB11BQ15907 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB11BQ15907 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB11BQ15907 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB11BQ15907 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11BQ15907 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB11BQ15907 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB11BQ15907 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11BQ15907 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11BQ15907 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11BQ15907 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11BQ15907 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11BQ15907 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11BQ15907 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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