Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOXF1Q12946 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FOXF1Q12946 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXF1Q12946 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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