Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ABCC8Q09428 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ABCC8Q09428 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC8Q09428 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC8Q09428 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC8Q09428 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ABCC8Q09428 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC8Q09428 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC8Q09428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC8Q09428 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC8Q09428 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC8Q09428 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.04■■■■■ 4
ABCC8Q09428 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC8Q09428 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC8Q09428 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ABCC8Q09428 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ABCC8Q09428 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
ABCC8Q09428 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ABCC8Q09428 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ABCC8Q09428 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
ABCC8Q09428 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms