Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F1Q01094 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E2F1Q01094 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E2F1Q01094 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms