Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD23BP54727 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD23BP54727 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23BP54727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms