Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RPL27AP46776 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms