Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJC1P36383 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJC1P36383 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJC1P36383 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJC1P36383 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJC1P36383 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJC1P36383 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJC1P36383 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJC1P36383 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJC1P36383 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJC1P36383 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJC1P36383 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJC1P36383 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJC1P36383 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJC1P36383 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJC1P36383 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms