Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD33P20138 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD33P20138 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD33P20138 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD33P20138 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CD33P20138 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CD33P20138 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD33P20138 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD33P20138 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD33P20138 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CD33P20138 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD33P20138 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CD33P20138 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD33P20138 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD33P20138 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CD33P20138 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CD33P20138 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CD33P20138 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CD33P20138 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms