Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT4P19013 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT4P19013 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT4P19013 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT4P19013 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT4P19013 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT4P19013 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT4P19013 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT4P19013 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT4P19013 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT4P19013 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT4P19013 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT4P19013 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT4P19013 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT4P19013 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT4P19013 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms