Protein–RNA interactions for Protein: P15514

AREG, Amphiregulin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AREGP15514 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AREGP15514 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AREGP15514 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AREGP15514 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AREGP15514 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AREGP15514 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AREGP15514 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AREGP15514 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AREGP15514 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AREGP15514 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AREGP15514 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AREGP15514 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms