Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV1P15498 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV1P15498 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAV1P15498 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAV1P15498 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAV1P15498 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAV1P15498 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAV1P15498 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV1P15498 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAV1P15498 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
VAV1P15498 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAV1P15498 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAV1P15498 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAV1P15498 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAV1P15498 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV1P15498 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV1P15498 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAV1P15498 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms