Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS6ST1O60243 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST1O60243 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST1O60243 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms