Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK1O15075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK1O15075 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK1O15075 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms