Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFRD1O00458 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms