Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TREX1Q9NSU2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TREX1Q9NSU2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms