Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SEC22CQ9BRL7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SEC22CQ9BRL7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SEC22CQ9BRL7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SEC22CQ9BRL7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SEC22CQ9BRL7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SEC22CQ9BRL7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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