Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKP4Q99569 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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