Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q71RC1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q71RC1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q71RC1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q71RC1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q71RC1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q71RC1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms