Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q6P435 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q6P435 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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