Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms