Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHDQ96IW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms