Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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AP5B1Q2VPB7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP5B1Q2VPB7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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