Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
AP5B1Q2VPB7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
AP5B1Q2VPB7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP5B1Q2VPB7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
AP5B1Q2VPB7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AP5B1Q2VPB7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AP5B1Q2VPB7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
AP5B1Q2VPB7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
AP5B1Q2VPB7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
AP5B1Q2VPB7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
AP5B1Q2VPB7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
AP5B1Q2VPB7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
AP5B1Q2VPB7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
AP5B1Q2VPB7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AP5B1Q2VPB7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AP5B1Q2VPB7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
AP5B1Q2VPB7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
AP5B1Q2VPB7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
AP5B1Q2VPB7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
AP5B1Q2VPB7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
AP5B1Q2VPB7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
AP5B1Q2VPB7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
AP5B1Q2VPB7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AP5B1Q2VPB7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AP5B1Q2VPB7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
AP5B1Q2VPB7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
AP5B1Q2VPB7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP5B1Q2VPB7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP5B1Q2VPB7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
AP5B1Q2VPB7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
AP5B1Q2VPB7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
AP5B1Q2VPB7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AP5B1Q2VPB7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AP5B1Q2VPB7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AP5B1Q2VPB7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AP5B1Q2VPB7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AP5B1Q2VPB7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AP5B1Q2VPB7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AP5B1Q2VPB7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AP5B1Q2VPB7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AP5B1Q2VPB7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
AP5B1Q2VPB7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP5B1Q2VPB7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AP5B1Q2VPB7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP5B1Q2VPB7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AP5B1Q2VPB7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AP5B1Q2VPB7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP5B1Q2VPB7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AP5B1Q2VPB7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP5B1Q2VPB7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP5B1Q2VPB7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP5B1Q2VPB7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP5B1Q2VPB7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP5B1Q2VPB7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP5B1Q2VPB7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP5B1Q2VPB7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP5B1Q2VPB7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP5B1Q2VPB7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP5B1Q2VPB7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AP5B1Q2VPB7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AP5B1Q2VPB7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP5B1Q2VPB7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
AP5B1Q2VPB7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP5B1Q2VPB7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AP5B1Q2VPB7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP5B1Q2VPB7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP5B1Q2VPB7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
AP5B1Q2VPB7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AP5B1Q2VPB7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP5B1Q2VPB7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP5B1Q2VPB7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AP5B1Q2VPB7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP5B1Q2VPB7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5B1Q2VPB7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AP5B1Q2VPB7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP5B1Q2VPB7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5B1Q2VPB7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP5B1Q2VPB7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP5B1Q2VPB7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP5B1Q2VPB7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP5B1Q2VPB7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP5B1Q2VPB7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AP5B1Q2VPB7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP5B1Q2VPB7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP5B1Q2VPB7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP5B1Q2VPB7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AP5B1Q2VPB7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP5B1Q2VPB7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP5B1Q2VPB7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AP5B1Q2VPB7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP5B1Q2VPB7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP5B1Q2VPB7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP5B1Q2VPB7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP5B1Q2VPB7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP5B1Q2VPB7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP5B1Q2VPB7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP5B1Q2VPB7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP5B1Q2VPB7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms