Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.549e-51■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 AD000671.1-201ENST00000591613 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 521.86■■□□□ 1.095e-9■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.942e-7■□□□□ 9.7
PABPC4Q13310 ATP5G2-207ENST00000552120 511 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -19e-13■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 SMARCE1-214ENST00000578112 2384 ntTSL 513.93□□□□□ -0.184e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 SMARCE1-207ENST00000469334 2128 ntTSL 59.82□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 PRMT1-205ENST00000525915 298 ntTSL 35.76□□□□□ -1.494e-18■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 05e-10■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.742e-6■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 EIF5B-202ENST00000470023 2331 ntTSL 25.66□□□□□ -1.54e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ITGA5-203ENST00000547197 757 ntTSL 316.96■□□□□ 0.314e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CCNB2-202ENST00000559301 575 ntTSL 223.9■■□□□ 1.428e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.968e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-209ENST00000581031 3013 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.958e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-211ENST00000601047 1127 ntTSL 520.1■□□□□ 0.818e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.648e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.68e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-215ENST00000583994 3289 ntTSL 218.09■□□□□ 0.498e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.398e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-208ENST00000600233 659 ntTSL 517.32■□□□□ 0.368e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-207ENST00000598985 900 ntTSL 517.08■□□□□ 0.328e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-214ENST00000601813 593 ntTSL 516.12■□□□□ 0.178e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-209ENST00000600741 624 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 315.35■□□□□ 0.058e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.048e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 315.29■□□□□ 0.048e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.038e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.218e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 511.99□□□□□ -0.498e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-207ENST00000580392 650 ntTSL 310.92□□□□□ -0.668e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-217ENST00000584852 421 ntTSL 510.92□□□□□ -0.668e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NPM1-206ENST00000519955 571 ntTSL 27.81□□□□□ -1.169e-24■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 KPNB1-209ENST00000580158 603 ntTSL 27.65□□□□□ -1.188e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-213ENST00000582586 426 ntTSL 36.88□□□□□ -1.318e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-206ENST00000578205 2771 ntTSL 1 (best)4.71□□□□□ -1.658e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.688e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 BCL2L12-205ENST00000594793 311 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-22■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)26.15■■□□□ 1.781e-23■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)23.52■■□□□ 1.367e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 312.67□□□□□ -0.383e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.097e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.859e-7■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.742e-11■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.951e-12■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-12■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -11e-12■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-206ENST00000479852 1938 ntTSL 1 (best)24.01■■□□□ 1.433e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.393e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.123e-9■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 RPS2-203ENST00000526586 878 ntTSL 211.59□□□□□ -0.552e-64■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.522e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-202ENST00000394225 664 ntTSL 217.93■□□□□ 0.462e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 TPM3-202ENST00000302206 741 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 NDUFC1-205ENST00000503997 628 ntTSL 312.52□□□□□ -0.412e-40■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 XRCC6-208ENST00000478914 550 ntTSL 210.63□□□□□ -0.712e-8■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 IPO5-202ENST00000357602 4335 ntAPPRIS P1 TSL 513.65□□□□□ -0.223e-19■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.58□□□□□ -1.523e-19■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.573e-19■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.372e-26■□□□□ 9.6
PABPC4Q13310 THAP7-205ENST00000471723 653 ntTSL 323.89■■□□□ 1.413e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 515.7■□□□□ 0.12e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PIEZO1-205ENST00000472168 663 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.812e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.682e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPL13A-203ENST00000468655 407 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-22■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BZW2-204ENST00000415365 1405 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)25.88■■□□□ 1.734e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.034e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RETREG2-202ENST00000420189 1781 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.124e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 TMEM97-202ENST00000336687 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.812e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRP14-203ENST00000558527 791 ntTSL 215.78■□□□□ 0.121e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CIZ1-211ENST00000467178 904 ntTSL 326.62■■□□□ 1.851e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CIZ1-221ENST00000488559 952 ntTSL 524.27■■□□□ 1.481e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CIZ1-202ENST00000324544 809 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.653e-8■□□□□ 9.5
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 371.9 ms