Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK18Q07002 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms