Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
ATP5EP56381 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms