Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRN4Q8WUT4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRN4Q8WUT4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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