Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A6P48664 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms